小鼠 TaqMan Copy Number Reference Assays 是在双重实时荧光定量 PCR 反应中，与预先设计的 Custom Plus 和 Custom TaqMan Copy Number Assays 一起运行，以检测和测量小鼠基因组的拷贝数变异。小鼠 TaqMan Copy Number Reference Assays 还与通用载体标记物和报告基因预先设计的 TaqMan Copy Number Assays 兼容。提供了两种在小鼠中可用作内源性参比基因的基因选项：Tfrc 和 Tert。TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒设计为小鼠参比基因组组装中独特的基因组序列 (NCBI Build 37/mm9)，并且是拷贝数靶标的相对定量所必需的。TaqMan Copy Number Assays 对目标基因进行定量，并标准化为一种已知存在于二倍体基因组的两个拷贝中的内源性参比基因。请注意，TaqMan Copy Number Reference Assays 具有种属特异性。Tfrc：标准参比基因选项TaqMan Copy Number Reference Assays 具有 VIC 染料标记的 TAMRA 探针和参比序列特异性正向和反向引物。该检测无引物限制性。TaqMan Copy Number Reference Assay、小鼠、Tfrc 是小鼠拷贝数分析的标准参比测定。该测定试剂盒检测染色体 16、cytoband 16qB3 上的转铁蛋白受体基因 (Tfrc)。测定位置为 chr.16:32626732，在 NCBI build 37 上。它具有 91 bp 扩增子，该扩增子映射于 Tfrc 基因的第17外显子内。TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒，小鼠，Tert 是一个替代参比测定试剂盒；如果由于染色体畸变或其他问题，Tfrc 测定试剂盒样品的功能很差，推荐使用此测定试剂盒。该测定试剂盒以染色体 13、cytoband 13qC1 上的端粒酶逆转录酶 (Tert) 基因为目标。测定位置为 chr.13:73778992，在 NCBI build 37 上。它具有 96 bp 扩增子，该扩增子映射于 Tert 基因的第8内含子内。可获得较简单的工作流程TaqMan 拷贝数测定具有目前所有可用的 CNV 分析方法的较简单的工作流程。将试验测定（FAM 染料标记的）、参比测定（VIC 染料标记的）、您的样品 DNA 与 TaqMan Master Mix 组合，然后使用标准 TaqMan Copy Number Assay 方案，在 Applied Biosystems 实时荧光定量 PCR 系统上运行。平均来说，设置为一级分析只需要3-4小时（包括约2小时 PCR 运行）。强大的数据分析软件CopyCaller 软件专为 TaqMan 拷贝数测定试剂盒数据分析而开发。这款免费、易于使用的软件采用图形界面，可快速计算运行中一组样品的可能拷贝数。它还为每个拷贝数的检出提供了置信度，并具有异常值检查功能。
