SPINeasy 粪便/土壤基因组DNA提取试剂盒,样品
货号:116547000 规格:5 preps

土壤和基质样本面临着不同的处理挑战。基质样本的组成取决于饮食,包括纤维、未消化的残渣、胆红素、复合多糖和脂类。这些物质破坏了样本的均一性,影响DNA提取的浓度和质量。土壤样本通常含有大量的抑制物,如腐殖酸、重金属和其他芳香族化合物,影响下游实验。
SPINeasy® DNA KIT FOR FECES / SOIL 用于从复杂的基质和土壤样本中提取出高质量的 DNA。试剂盒内含最新生产的透析介质 YB 和透析缓冲液 SF1,通过研磨珠破坏法彻底透析样本,然后使用缓冲液SF2进行处理,可有效去除去除保存酸和其他去除步骤。缓冲液SF3能够在不添加RNase的情况下,更好的去除RNA,实现DNA去除结合。去除额外的去除步骤,从严重污染的土壤样本中提取的DNA,即可重建下游实验,包括长片段PCR,qPCR和二代测序(16S和全基因组测序)。
表现:-

图 1:使用 SPINeasy DNA 粪便/土壤试剂盒制备的不同饮食动物的粪便样本。

图 2:使用 SPINeasy DNA Kit for Feces/Soil 和竞争对手的试剂盒从高生物量/污染物土壤样品中提取 DNA。DNA 质量。分别使用分光光度计一式四份和 DNA 凝胶评估 DNA 产量、纯度(A260/280 和 A260/230 比率)和完整性。图中的每个点代表一次提取。水平条表示中值。放大性。从土壤中获得的 DNA 更容易受到抑制剂污染。使用抑制剂敏感 PCR 和未稀释样品以及定量 PCR 确认使用 SPINeasy DNA Kit for Feces / Soil 试剂盒获得的土壤样品中不存在抑制剂。16s微生物分析。使用图例中描述的 4 个提取试剂盒提取的 DNA 扩增细菌 16S rRNA 基因的高变区 V4。使用 NovaSeq PE250 平台获得序列并使用 Qiime 2 管道进行分析。左侧显示了由 4 次技术重复编制的细菌物种的相对丰度。该百分比表示来自同一土壤样本的 DNA 样本中发现的革兰氏阳性厚壁菌门(绿色)的平均比例。右侧描绘了每种方法对应的稀疏曲线。α多样性通过测序深度(横轴)之后识别的操作分类单元(OTU)的数量(纵轴)来测量。该百分比表示来自同一土壤样本的 DNA 样本中发现的革兰氏阳性厚壁菌门(绿色)的平均比例。右侧描绘了每种方法对应的稀疏曲线。α多样性通过测序深度(横轴)之后识别的操作分类单元(OTU)的数量(纵轴)来测量。该百分比表示来自同一土壤样本的 DNA 样本中发现的革兰氏阳性厚壁菌门(绿色)的平均比例。右侧描绘了每种方法对应的稀疏曲线。α多样性通过测序深度(横轴)之后识别的操作分类单元(OTU)的数量(纵轴)来测量。
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